در این بخش بررسی هورمونهای غدد درون ریز بدن مانند تیروئید، هیپوفیز، تخمدانها، بیضه ها، پانکراس، فوق کلیوی و نیز جفت با کیتهای معتبر اروپایی و ایرانی انجام می شود. دستگاه الایزا ریدر Statfax به عنوان خوانشگر نهایی تستهای انجام شده در این بخش مورد استفاده است.
مدیریت آزمایشگاه، حساسیت خاصی بر عدم استفاده از هر نوع تستهای راپید نواری در این بخش داشته، استفاده آنها را به تنهایی برای گزارش نتایج بیماران، تضییع حق الناس می داند. این بخش یکی از پر هزینه ترین و درعین حال حساسترین و دقیق ترین واحدهای آزمایشگاه است که قطعاً سرمایه گذاری در آن و توسعه کمی و کیفی آن، از مهمترین اولویتهای آزمایشگاه دکتر شفیعی است.